我们的世界正以难以想象的方式发生变化。为了生存，两个青少年必须做好一切准备。
查理(夏洛特饰)是一个来自社会底层的极客科学天才，因为设计炸弹而被不公正地送进监狱。哈里是一个有抱负的有才华的记者，他的抱负和道德并不总是在同一轨道上运行。在基因编辑技术开始迅猛发展的时代，这两者以各自的方式，危险地、不可抗拒地走到了一起。
现在，有了车库里的实验室，任何人都可以战胜癌症，增强大脑以通过考试，或调整一些基因以获得全年晒黑和完美的海滩身材。但是基因编辑是历史上最致命的武器。
杀手T是一种合成病毒，死亡率高达90%，制造它的恐怖分子想要一大笔赎金，然后才能释放解药……
《杀手T病毒》提出了深刻(通常也很可怕)的问题，是一个不带感情色彩的爱情故事，一个关于人类韧性的跌宕起伏的故事，最重要的是，它是我们这个时代的一部小说。故事分为六个部分，前后跨越十二年。
【一】
该部分讲述了14岁少年哈利（Harry）的故事。哈利是拉斯维加斯高中一名有抱负的学生记者。学校发生了一起爆炸案，而哈利出于记者的热情开始着手调查此事。在这个过程中他结识了查莉（Charlie），这个13岁女孩在自然科学方面很有天分。查莉和她的守财奴姐姐弗恩（Fawn）以及智障弟弟艾德（Ed）居住在镇上。爆炸案的幕后黑手正是弗恩的未婚夫JJ。弗恩因贪婪伙同JJ及他有钱的家人一起，企图混淆视听将罪责嫁祸给妹妹查莉。查莉因此被判处在少管所服刑两年。
【二】
这部分故事承接第一部分，发生在两年之后。这期间产生了一种叫“斯诺（SNor）”的人造合成病毒，由这种病毒引起的几起死亡案例并未得到广泛关注。查莉也从少管所结束服刑重新回到社会。服刑期间，她一直和哈利保持着联系，哈利给查莉带来他的新闻报纸，令后者时刻了解外界发生的事情，这对于查莉来说大有裨益。查莉努力开始融入社会，开始自己的新生活。她遇到了一个叫曼戈（Mango）的人，并为其在一个基因编纂实验室工作。这两年的接触让哈利喜欢上了查莉，他一直想对查莉表白但却苦于没有机会。然而就在这时，查莉结识了一名叫布拉德（Brad）的男孩并与之交往甚深。这对于哈利是个不小的打击。心碎的哈利断绝了同查莉的联系。
【三】
时间又过去两年。一种新病毒在英国境内肆虐。此时基因编纂工作已经被列为违法，但查莉依旧在曼戈的实验室工作，这时的查莉在工作方面得心应手、有所成就。哈利利用当下的基因更改技术改变了他的外貌，凭借帅气的外表，哈利成了派对红人，每日沉溺在各种社交活动当中。他和朋友马特（matt）一起，过着频繁更换女朋友的纸醉金迷的生活。虽然这几年哈利没再联系过查莉，但从朋友处得知FBI已经盯上了从事着违法基因编纂工作的查莉。与此同时，被命名为杀手T（Killer T）的病毒已经蔓延到美国。查莉和曼戈为研发疫苗而彻夜埋头工作，最终查莉给了哈利一剂疫苗。
【四】
“杀手T”病毒肆虐的三年后，查莉和哈利都侥幸活命，但该病毒也给社会带来了毁灭性的破坏。劫后余生的二人组建了家庭。查莉经营了一家咖啡店，也开设了自己的基因实验室；哈利则在玻璃隧道中依靠种植农作物度日。灾难后的社会毫无法制可言，他们每日过着提心吊胆的生活。他们竭力在动乱的社会环境下平静生活，但在一次袭击中，为了保护查莉和这个家，哈利遇害了。查莉和弟弟艾德被一群神秘人抓住带走。
原来，事件的策划者竟然是弗恩，弗恩威胁艾德，并袭击查莉。但艾德却出人意料地用手榴弹进行了自救。
【五】
哈利死后数月，查莉一直没能从悲伤中走出来，接受这个残酷的现实，直到她结识了一个不可思议的耿直的修女。修女被叫做“神奇姐”，她开始帮助查莉，给她以指引。
【六】
哈利去世五年后，查莉通过基因技术生育了一个孩子，她叫他小哈利。这个孩子结合了哈利70%的基因和查莉30%的基因。查莉开设了一家机构去帮助那些感染了“杀手T”病毒的人们。怀着对哈利的思念，查莉坚强而努力地与生活抗争着……