接上部，18年后，幸存者都已成人。醒悟过来的Halloween很痛苦，决定在美国放逐自己，而他的伙伴们寻找重新入住地球的途径，重建文明。他们是人类最后的希望，也是唯一的最大希望。但是，意识形态的分歧把他们分化成两个不同的派别。一类要复兴人类，而另一类要全力以赴通过基因工程改善人类。于是一代新人类出生了，但当新人类成长起来后，很清楚面对的情况很不好。有人——或者有什么东西——开始威胁他们的童心。谜团越来越多，一种生物威胁向他们靠近，就像一场致命的瘟疫威胁数十亿生命。幸存者必须团结起来。但是，为了挽救未来，Halloween必须首先忘记过去。