1868年，波士顿。内战也许已经结束，但一场新的战争，一场介于过去和现在、传统和技术之间的战争已经开始。敢于冒险的麻省理工学院的使命是利用科学造福全人类。但是，当一场非自然的灾难袭击了波士顿港的船只，一场同样无法解释的灾难摧毁了市中心，反科学派的强烈反对使麻省理工学院被笼罩在了阴影之中，甚至使它的存在遭到了威胁。因此，研究所第一届毕业生中最优秀、最聪明的人们为了拯救无辜生命，追查真相，开始秘密地展开合作。天才的退伍军人马库斯•曼斯菲尔德（Marcus Mansfield）、拥有贵族血统的罗伯特•理查兹（Robert Richards）、天才埃德温•霍伊特（Edwin Hoyt）和才华横溢的新生埃伦•斯沃恩（Ellen Swallow）将凭借他们的聪明才智和独特的科学训练，与一个一心只想彻底摧毁这座城市的犯罪大师展开斗智斗勇。