《爱丽丝•琼斯：不可能的线索》是一部适合中年级阅读的系列作品的第一本，主角是数学怪才——爱丽丝•琼斯，在故事开始前她已经解决了一两个谜题了。
在第一本中，她被她的准朋友山米说服，介入调查一个失踪的科学家，她很快就发现自己陷入了一个理不清头绪的局面中。科学家失踪真的是因为隐形术吗？还是有什么更加凶险的东西存在？
第二部：《爱丽丝•琼斯：鬼灯》
这一年的十二月非常寒冷，爱丽丝的生活也不顺。她那身为记者的老爸正忙于写一个调查稿，内容关于慈善舞会上的盗窃。所以爱丽丝的假期就只好蜷在沙发上喝可可饮料，研究费马大定理，另外就是帮她的戏剧迷老妈和姐姐拯救绿柱石剧院。
绿柱石剧院是17世纪费城最好的剧院，但是经历一场火灾，且年久失修，剧院破旧不堪。热爱剧院的人们只有通过筹款才能保住剧院，否则市政府会让娱乐大亨利克斯先生将剧院夷为平地，建起一个巨型电影院。于是人们沿袭剧院演出的传统，在各地表演筹集基金。
本来巡回表演不会出岔子，但是在演出开始的五天前，麻烦来了：道具失踪了、固定的设备移动了、服饰搞乱了。
黛拉认定混乱的产生是因为绿柱石的诅咒应验了，于是雇佣爱丽丝找出安抚鬼魂的方法。爱丽丝却觉得世界上根本没有鬼，不过她接下了这个案子，并决心找出混乱局面的合理解释。
起初爱丽丝怀疑是有人试图破环表演，但是当她深入研究剧院的历史，她发现除了这个谜团外，这家剧院还有其他的谜团。1877年那场几乎焚毁剧院的大火导致了一个事件——一串名为“午夜之星”的钻石项链从那以后再未出现过。所有人都认为那串项链是在火灾时被盗了，但是爱丽丝综合分析所有的线索，发现“午夜之星”其实还藏在剧院内。那么到底谁是所有混乱灾难的始作俑者呢？
在朋友凯文的帮助下，爱丽丝一步步确认盗贼的身份：是好莱坞巨星马修•斯汤杰吗？是阴戾的剧院经理贾维斯吗？还是剧院的资助人、社会名流伊瑞科•巴斯克？又或者是舞台监制彼得（他对爱丽丝的调查似乎产生了兴趣）？
这些人中是否有哪一个和爱丽丝老爸的调查有关系呢？疑犯太多，可是线索很少。这就像是要解开一个有很多变量的方程式。
演出的时间越来越近，盗贼似乎更加疯狂，舞台的灯莫名其妙地掉在了地上。在事情越来越诡异的情况下，爱丽丝、凯文和黛拉为盗贼布下了一个陷阱，用一串仿制的“午夜之星”诱惑他。
后台的一系列追踪之后，爱丽丝终于让罪犯现身，原来是伊瑞科•巴斯克。爱丽丝把他交给警察。原来被爱丽丝列为头号嫌疑的贾维斯是隐藏在剧院的便衣警察。爱丽丝还给她老爸提供了独家新闻。
在演出的那天晚上，爱丽丝却感到了不满足。她也许解开了黛拉给她的案件，但是“午夜之星”失踪却仍是一个谜案。
爱丽丝一边看表演，一边回顾线索，想要找出她是否遗漏了什么东西。舞台变幻场景时，她发现用来平衡舞台的沙袋少了一个。
她跑到大堂展示厅，发现了那个沙袋。当爱丽丝在剧院的观众面前砸开沙袋，沙子流出，那串“午夜之星”出现了。爱丽丝获得了热烈的掌声。