詹森·德森（Jason Dessen）是一位四十岁的物理学教授，与妻儿一起生活在芝加哥。一天晚上，他与一位刚荣获天体物理学权威奖项的老室友庆祝了一番之后，便往家里赶。
但他没能回家。
一个带着艺妓面具的男人忽然用枪指着他，强迫他坐上了一辆黑色SUV的驾驶座。詹森在枪口下驱车来到了芝加哥市南端，绑架他的人押着他来到了密歇根湖岸边的一座废弃的发电厂内。詹森觉得自己可能会遭受折磨，然后被杀害，但是没有，他只是被注射了一剂强大的药物。
詹森再次恢复意识的时候，发现自己周围都是穿着防护服的人，这些人用担架抬着他，穿过一间奇怪的飞机库，进入了一处隔离区。在那里，有个年轻的医生低头看着他，对他微笑着说，“欢迎回来。”
詹森即将得知一个令人震惊的真相：他一直认为属于自己的那个世界，原来完全是错误的。
《暗物质》（Dark Matter）讲述的是现实世界与个人身份的本质问题。该小说不但是一本节奏快如闪电的惊悚小说，也是一个探索人类生存之谜的故事，故事里演绎了粒子与超弦理论的世界，让科学与哲学发生了碰撞。这个故事发生在当代，地点主要在芝加哥，而且建立在一个爱情故事的基础之上。
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